Die Gemeinde Vilgertshofen wird geführt durch den hauptamtlichen 1. Bürgermeister Dr. Albert Thurner (Ortsteil Vilgertshofen), den 2. Bürgermeister Mario Dangel (Mundraching) und den 3. Bürgermeister Markus Müller (Issing).
Der Gemeinderat setzt sich zusammen aus 1. Bürgermeister Dr. Albert Thurner und den gewählten Mitgliedern:
- Beate Karmann, Dietmar Kreitner, Markus Müller, Sascha Pilz und Markus Schwenk von der Freien Wählerschaft Issing
- Michael Drews, Stefan Erdt, Stefan Hieber und Maximilian Schneider von der Dorfgemeinschaft Pflugdorf
- Thomas Lindner und Alexander Sturm von der Dorfgemeinschaft Stadl
- Mario Dangel und Hauke Jungjohann von der Ortsgemeinschaft Mundraching
- Dr. Peter Friedl von Bündnis90/Die Grünen